829

Molecular Docking and Reactivity of antiviral activity of echinopsine derivatives containing acylhydrazone moiety against tobacco mosaic virus

كارشناسي ارشد

شيمي تجزيه

پيام نور مركز كرمان

1401

1401/10/25

عالي

70ص

محدثي زرندي، عليرضا، مددي ماهاني، نصرت

ص66-69

molecular docking, tobacco mosaic virus (TMV), antiviral activity, multiple linear regression, quantitative structure-activity relationship (QSAR).

پيام نور مركز كرمان

ويروس موزاييك تنباكو، زيان اقتصادي زيادي به تنباكو، فلفل، خيار و گلهاي زينتي در سراسر جهان وارد مينمايد. هنوز هيچ مطالعهاي نتوانسته است عامل مؤثري را پيدا كند كه بتواند به طور كامل بيماري ناشي از ويروس را مهار ميكند. در سالهاي اخير، روشهاي داكينگ مولكولي و ديناميك مولكولي به عنوان يكي از مهمترين روشهاي كشف و طراحي دارو، براي ارزيابي نوع اتصال بين ليگاند و پروتئين آن استفاده ميگردد. در اين تحقيق، واكنش پذيري و كارايي اتصال مولكولي 27 تا از مشتقات جديد اكينوپسين حاوي قطعات آسيل هيدرازون كه فعاليت ضد ويروسي آنها را در برابر ويروس موزاييك تنباكو ) TMV ( مشخص شده است را با پروتئين پوششي ويروس موزاييك تنباكو ( V2OM3 ) مورد بررسي قرار گرفت. براساس انرژي آزاد منفي حاصل از شبيه سازي داكينگ مولكولي، تقريباً تمامي مشتقات مورد مطالعه فعاليت ضد ويروسي خوبي را نشان ميدهند. همچنين، تعداد پيوندهاي هيدروژني و هيدروفوبيكي حاصل از آناليز اتوداك برهمكنش كمپلكسهاي پروتئين ليگاند براي هر يك از ساختارها - قابل توجه ميباشد. همچنين رابطهي كمي ساختار فعاليت - (QSAR) با استفاده از توصيفگرهاي حاصل از داكينگ مولكولي و مكانيك كوانتومي مورد ارزيابي قرار گرفت. مدل سازي با استفاده از روش رگرسيون خطي چند متغيره (MLR) انجام گرفت. مشخص شد كه توصيفگرهاي انرژي پايينترين اوربيتال مولكولي اشغال نشده (LUMO) و تغييرات انرژي آزاد گيبس از متغيرهاي مكانيك كوانتومي در مدل نقش دارند. همچنين توصيفگر مجموع انرژي برهمكنشهاي واندروالس، پيوند هيدروژني و انحلال (vdW + Hbond + desolv Energy) از توصيفگرهاي داكينگ مولكولي در مدل رگرسيون تاثير دارند.

1402/05/24

73024