۲۴۵۹پ

Hydrogen bond interaction study of guanine -water complex by NBO and AIM Analysis

كارشناسي ارشد

شيمي‌ فيزيك

دانشگاه پيام نور اردكان

۱۳۹۶

۸۷ص.

بهجت‌منش اردكاني ، رضا

۸۲-۸۵

guanine, water, hydrogen bonding, Natural bond orbital, Theory of atoms in molecules

گوانين يكي از مهم‌ترين بازهاي اسيد نوكلئيك با فرمول شيميايي C5H5N5O است كه در ساختار DNA وRNA ديده مي‌شود و در انتقال انرژي سلولي، تشكيل عوامل وراثتي و... نقش دارد. ميزان غلظت اين ماده مي‌تواند به عنوان علامتي براي تشخيص سرطان‌ها، صرع، آلوده بودن به ويروس HIV به‌كار رود. از طرف ديگر آب يكي از فراوان‌ترين تركيبات شيميايي در زمين است و درصد بالايي از تركيب سلول را تشكيل مي‌دهد و اولين اطلاعات بر روي DNA بدست آمده توسط پراش اشعه X نشان داد كه DNA بسيار هيدراته است و فعل و انفعالات با آب مسئول تغييرات ساختاري آن مي‌باشد. به دليل اهميت موضوع، در اين تحقيق با استفاده از روش‌هاي محاسبات شيمي كوانتومي تابعيت چگالي موجود در نرم‌افزار Gaussian 2009برهم‌كنش پيوندهاي هيدروژني بين شش كمپلكس از گوانين - آب در سطح B3LYP/6-311(++)G(d,p) بهينه‌سازي و بررسي شد. سپس محاسبه فركانس در سطوح نظري ذكر شده براي تمامي ساختارها انجام شده و انرژي ارتعاشي نقطه صفر (ZPVE) آن‌ها محاسبه گرديده و تصحيح مربوط به آن در تعيين پايداري اعمال شده است. ترتيب پايداري كمپلكس‌ها با استفاده از انرژي اتصال، خواص توپولوژي و داده‌هاي انتقال بار كه به ترتيب از نرم‌افزار اتم در مولكول (AIM) و برنامه اوربيتال پيوند طبيعي (NBO) به‌دست آمده، تجزيه و تحليل شده است. از نتايج بدست آمده مربوط به محاسبات انرژي اتصال و بهينه‌سازي ساختارها، كمپلكس شماره 4 به‌عنوان پايدارترين كمپلكس شناسايي شد ونتايج محاسبات بدست آمده از AIM و NBO نيز آن را تاييد كردند.

۱۳۹۷/۴/۱۱

46864