پ.م.ك.۱۴۲۷

Design of epitope for POMC gene for skin cancer (melanoma) by means of immunoinformatic method

كارشناسي ارشد

كشاورزي - بيوتكنولوژي

مركز كرج

۹۶

۹۶/۰۶/۲۱

بسيارخوب

۸۰ص.

ابراهيمي، محمدعلي

دهقان شاسلطنه، مرضيه

ص:۷۵-۷۹

پ استاد راهنما ابراهيمي، محمدعلي , پ استاد مشاور دهقان شاسلطنه، مرضيه

سرطان پوست شايع‌ترين سرطان در انسان است. ملانوما يكي از تومورهاي بدخيم پوستي است. اين بيماري بايد به موقع درمان شود. ملانوما در اثر تغيير در ملانوسيت‌ها (سلول‌هاي رنگدانه‌اي پوست) ايجاد مي‌شود. اين تومورها ممكن است در زمينه يك پوست به طور كامل سالم و ياحتي در بستر ناخن ايجاد شده و يا در زمينه يك خال قبلي خود را نشان دهد. ‌ملانوما علاوه بر پوست، در مخاط دهان و چشم نيز ايجاد مي‌گردد. ژن درگير در سرطان ملانوما POMC (پرواوپيوملانوكورتين) است. روش‌هاي نوين ايمونوانفورماتيك راهبردهاي تازه‌اي را جهت شناسايي، طراحي و ساخت اپي‌توپ‌هاي اختصاصي آنتي‌ژن جهت استفاده در مقاصد گوناگون نظير، واكسن‌ها، آلرژي‌ها، ايمني‌درماني و غيره فراهم آورده است. الگوهاي تازه در طراحي واكسن‌ها، شناسايي آلرژن‌ها و ايمني‌درماني به واسطه اكتشافات مهم در علم ايمني‌شناسي و توسعه ابزارها و الگوريتم‌هاي پيشگويي اپي‌توپ‌هاي سلول B وT، امري ضروري است. با كمك ابزارهاي ايمونوانفورماتيك نظير برنامه‌ها و پايگاه داده‌هاي پيشگويي اپي‌توپ، مي‌توان بر روي پروتئين ايمونوژن موردنظر خود تمركز كرده و به طور قابل توجهي از تعداد آزمايش‌هاي in vitro بكاهيم .در اين پژوهش، تلاش شده تا با استفاده از دانش بيوانفورماتيك و ايمونوانفورماتيك و پيش‌بيني اپي‌توپ‌ سلول T لنفوسيت – داكينگ ژن مورد نظر و استفاده از سرور HADDOCK- پتانسيلي جهت پيشگيري از اين بيماري، تشخيص و درمان آن ميسر كرد تا بدين طريق از معايب روش‌هاي آزمايشگاهي و تجربي كاسته شود. بنابراين، با استفاده از داده پايگاه IEDB، اپي‌توپ‌هاي مناسب براي MHC II تعيين، بعد از ارزيابي هاي مناسب، سازه نهايي تشكيل شد. در نهايت جهت بررسي جايگاه اتصال پروتئين مدنظر و MHC II، داكينگ پروتئين- پروتئين به وسيله HADDOCK انجام شد. نتايج بدست آمده حاكي از شناسايي صحيح اپي‌توپ‌هاي پيش‌گويي شده توسط MHC II بود.

۹۷/۰۱/۲۱

كشت كار، زهرا

45569