-
شماره راهنما
7352
-
پديد آورنده
مولائي آراني ، مرتضي
-
نويسنده
مرتضي مولائي آراني
-
عنوان
بررسي و تجزيه بيوانفورماتيكي ژن كليدي )PGM( Phosphoglycerate Mutase
-
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
-
رشته تحصيلي
مهندسي بيوتكنولوژي كشاورزي
-
محل تحصيل
پيام نور , كتابخانه مركزي دانشگاه پيام نور
-
سال تحصيل
1392
-
مشخصات ظاهري
115ص
-
استاد راهنما
نقوي، محمدرضا
-
استاد مشاور
ابراهيمي ، محمدعلي
-
كتابنامه
113-110ص
-
توصيفگر فارسي
تنفس ، گليكوليز، PGM، بيوانفورماتيك ، تجزيه فيلوژنتيكي
-
شناسه هاي افزوده
پ مولائي آراني ، مرتضي , ع
-
چكيده
فسفوگليسرات موتاز )PGM( يك آنزيم ترانسفراز(انتقالي )است كه در مرحله هشتم از فرايند گليكوليز عمل ميكند .آنزيم فسفوگليسرات موتاز )EC 5.4.2.1( )PGM( جابجايي قابل برگشت گروه فسفريل را بين كربنهاي 2 و 3 فسفوگليسرات كاتاليز مي كند Voet et al., 8002(Ý Crowhurst et al., 9991(. PGM در تمام موجودات زنده يافت ميشود و توالي آن در طول تكامل به شدت حفاظت شده است )Winn et al., 2102(. بهمنظور بررسي روابط فيلوژنتيكي PGM ،196 توالي پروتئيني در گياهان ، جانوران و ميكروارگانيسمها و 133 داده نوكلئوتيدي) ژن (در گياهان ، جانوران و ميكروارگانيسمهايي كه ژن pgm در آنها توالييابي شده است بههمراه دو نمونه اصلي (مدل )از هر سه گروه ، درنظر گرفته شدند .در بررسيهايي كه توسط نرمافزار MegAlign و روش CLUSTAL W انجام شد، بيشترين تشابه بر اساس تخمين فاصله در ميان دادههاي پروتئيني گياهان در ميان گونه هاي مختلف خانواده Rosaceae مشاهده شد .بيشترين تشابه مربوط به CAA82925( -)Prunus dulcis, PdPGMوCAA51260( - )Malus x domestica, MdPGMكه داراي 053/0 فاصله بودند .در ميان خانواده هاي مختلف نيز بيشترين تشابه بر اساس تخمين فاصله مربوط به EEF99224( - )Ricinus communis, RcPGMاز خانواده Euphorbiaceae وXP_696323200( - )Populus trichocarpa, PtPGMاز خانواده Salicaceae ميباشد كه داراي 350/0 فاصله بودند .كمترين تشابه نيز مربوط به XP_574715300( - )Glycine max, GmPGMوXP_709060300( - )Micromonas pusilla, MpPGMميباشد كه داراي 476/3 فاصله بودند .در بين گياهان در سطح ژن نيز بيشترين تشابه بر اساس تخمين فاصله در ميان گونه هاي مختلف خانواده Solanaceae مشاهده شد كه 088/0 فاصله بودند .كمترين تشابه نيز متعلق به XM_168060300( - MpPGM )Micromonas pusilla, MpPGMوNM_040152100(- )Glycine max, GmPGMميباشد كه 906/2 فاصله بودند .در آناليزهايي به منظوربررسي خصوصيات ساختاري پروتئين PGM در 5 نمونه اصلي (مدل )انجام شد(آرابيدوپسيس و كرچك ، مگس سركه و انسان ، ايكولاي )، وجود هيچ دومين گذرنده از غشاء در آنها تÊييد نشد .همچنين هيچكدام از آنها داراي پپتيد نشانه نبودند .در هر پنج نمونه مارپيچ آلفا و فنر مارپيچ تصادفي بيشترين اجزاء ساختاري را تشكيل ميدهند درحاليكه رشتههاي گسترده و پيچ بتا بهصورت متناوب در پروتئين پراكنده شدهاند .همچنين در تعيين دمينهاي عملكردي كه توسط ProDom انجام شد، دمينهاي مشترك در 3 نمونه اصلي آرابيدوپسيس ، كرچك و باكتري ايكولاي و در 2 نمونه اصلي مگس سركه و انسان مشاهده شد .با توجه به بررسيهاي انجام شده ، تÊييد ميشود كه PGM يك آنزيم كاتاليزكننده در فرايند گليكوليز ميباشد و تمام گياهان داراي ژن pgm و ساير موجودات زنده از نظر فيلوژنتيكي در يك منشاء تكاملي مشترك سهيم هستند .
-
مندرجات
فصل اول : مقدمه . فصل دوم :بررسي منابع. فصل سوم : موادوروشها. فصل چهارم :نتايج . فصل پنجم : بحث ونتيجه گيري
-
تاريخ نمايه سازي
2931/20/13
-
شماره مدرك
7352پ
-
اطلاعات ثبت
1
-
شماره ركورد
21170
-
لينک به اين مدرک :