پ.م.ك.446

Sp-Mf performance Analysis , A synthetic pathogen Inducible promoter using Agroinjection Method In tobacco plant

كارشناسي ارشد

بيوتكنولوژي

مركز كرج

93

30/06/93

عالي

150ص.

شكوهي فر، فرهاد

ابراهيمي، محمد علي

ص:142-150

پ استاد راهنما شكوهي فر، فرهاد , پ استاد مشاور ابراهيمي، محمد علي

ويروس موزائيك توتون (TMV) ، يكي از مهمترين عوامل بيماريزا در سراسر دنيا است كه بيش از 200 گونه گياهي را آلوده مي نمايد. هر يك از اجزاي مختلف ژنوم داراي نقش مهمي در ساختار ژنوم ويروس مي باشد، از جمله پروتئين حركتي كه در حركت سلول به سلول در TMV موثراست و پروتئين پوششي كه نقش مهمي در پايداري و انتقال ويروس ايفا ميكند. درايران در خصوص تعيين توالي كامل ژنوم ويروس موزائيك توتون تا كنون اقدامي صورت نگرفته است. لذا تعيين توالي ويروس و مطالعه تفاوت هاي جدايه هاي موجود در كشور با اطلاعات موجود در منابع از جمله اقدامات اوليه و ضروري جهت انجام مطالعات مولكولي روي اين ويروس است، بنابراين با هدف بررسي توالي ژن كدكننده پروتئين حركتي و پروتئين پوششي در جدايه گزارش شده از ايران و مقايسه توالي تعيين ترادف شده با جدايه هاي مختلف در بانك ژن NCBI مطالعه حاضر انجام شد. توالي ژن كدكننده اين پروتئين ها در جدايه هاي مناطق مختلف دنيا گزارش شده است. استخراج RNA ژنومي ويروس از برگ گياهان توتون آلوده بدست آمد و با استفاده از پرايمر PSh60-R1 مرحله ساخت cDNA انجام شد. با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي PSh63-F و PSh60-R1 منطقه كدكننده پروتئين حركتي و پروتئين پوششي تكثير و بصورت دو جهته توالي يابي شد. همرديفي توالي بدست آمده با توالي مشابه از نژادهاي مختلف انجام شد و درخت خويشاوندي رسم گرديد. نتايج نشان داد جدايه گزارش شده از ايران با نژاد TMV-U1 قرابت بالائي دارد. از بين 799 جايگاه در سطح نوكلئوتيد براي پروتئين حركتي 6 جهش در مقايسه با نژاد TMV-U1 مشاهده و در مجموع 266 اسيد آمينه 2 جهش ديده شد. آناليزهاي انجام شده براساس توالي نوكلئوتيدي كد كننده ناحيه پروتئين پوششي ويروس در مقايسه با نژاد TMV-U1 2 جهش در سطح نوكلئوتيد را نشان داد. در توالي هاي بالادست و بينابين دو ژن كدكننده پروتئين پوششي و حركتي نيز جهش هايي مشاهده شد. جهش در اين مناطق به دليل نقش تنظيمي در بيان ژن حائز اهميت است.

05/07/95

كشت كار، زهرا

34839